Каков Цинковый Палец?
Цинковый палец - складка белка формы пальца, которая сформировали определенные аминокислоты в белке, затвердевающем к цинковому иону. Цинковые белки пальца часто затвердевают к ДНК и РНК, потому что их форма позволяет близкое взаимодействие домена с нуклеотидами ДНК и РНК. Их связующие способности нуклеотида позволяют им функционировать в регулировании экспрессии гена и в вирусной сборке.
есть несколько типов цинковых структур пальца, но наиболее распространенная версия состоит из винтовой альфа-спирали и листа беты, двух наиболее распространенных вторичных структур в белках, по обе стороны от по крайней мере одного цинкового иона. Винтовая альфа-спираль и лист беты проводятся в положении цистином и остатками гистидина, координируя цинковый ион через их азот и атомы серы. Цинковый палец затвердевает к ДНК, и через взаимодействие аминокислот в периферии цинкового пальца с парами азотистых оснований в центре двойной винтовой снирали ДНК. Это - компактный домен белка, и его небольшой размер позволяет этому иметь непосредственную близость с парами азотистых оснований ДНК.
Цинковые белки пальца - наиболее распространенные транскрипционные факторы в живых организмах. Транскрипционный фактор - белок, который затвердевает к ДНК и управляет передачей генетической информации к РНК. Способность цинковых белков пальца иметь целью ДНК сделала их кандидатами на целеустремленную переразработку, чтобы иметь целью последовательности ДНК интереса.
Например, Цинковая Нуклеаза Пальца (ZFN) является синтетическим белком, у которого есть спроектированный цинковый палец обязательный домен, сплавленный к эндонуклеазе ограничения, или расщепляющему ДНК ферменту. ZFN может использоваться, чтобы сократить ДНК в определенных местоположениях, и является полезным инструментом, чтобы поддержать сайт-специфическую рекомбинацию ДНК. Спроектированные цинковые пальцы могут также использоваться в качестве искусственных транскрипционных факторов.
Цинковые домены пальца найдены в некоторых вирусных белках, включая neocapsid (NC) белок иммунодефицита человека 1 (ВИЧ 1) вирус. NC - привлекательная противовирусная цель, потому что это важно для вирусной сборки и чрезвычайно сохранено. Ингибиторы, которые определенно имеют целью цинковые пальцы вирусных и ретровиральных белков, могли использоваться, чтобы предотвратить вирусное снятие реплики. Получение противовирусных составов этой природы является зоной гемолиза биомедицинского исследования.
Цинковые белки пальца играют важные роли в нормальном метаболизме клеток. Чтобы быть эффективными, составы антиретровирусного средства должны определенно иметь целью ретровиральные цинковые белки пальца. У этих ретровиральных белков есть отличные последовательности аминокислот и структурные различия от клеточных цинковых белков пальца, так получение избирательно действующих ингибиторов является достижимой целью.